生物信息学与精准医疗研究团队
生物诊疗中心
二附院团队负责人简介:
刘朋飞博士近年来主要从事“氧化应激与细胞代谢调控”方面的研究工作,以氧化应激中枢调控因子NRF2为核心,深度解析疾病机理,阐明了NRF2在肝脏糖脂代谢、肿瘤发生等疾病中的关键调控机制;基于NRF2小分子调节剂,建立了多种代谢调节、氧化损伤修复和肿瘤化疗模型;通过小分子化合物高通量筛选技术,开发了靶向NRF2的新型先导化合物,从而有力促进了氧化应激疾病诊疗领域相关研究理论的实践应用和技术转化。近年来先后承担国家自然科学基金面上项目、青年基金项目等科研项目9项,授权中国发明专利3项、美国发明专利1项,已累计在国内外期刊发表学术论文60余篇,其中以第一或通讯作者发表的SCI论文34篇(总影响因子235.8,H指数=23),多篇文章发表于本领域国际权威杂志,例如:Hepatology(IF=14)、PNAS(IF=11.1)、Redox Biology(IF=11.4,4篇)、Plos Biology(IF=9.8)等。目前,研究成果已被引用1800余次,其中ESI高被引论文3篇,多项研究被国际知名专家认可并发表专题评述。基于上述工作,申请人先后获评“陕西省青年科技新星”、“西安市引进海外高层次人才”和“西安交通大学青年拔尖人才”,兼任中国生物物理学会自由基生物学与自由基医学分会—青委会委员、中国细胞生物学学会会员、美国毒理学会(Society of Toxicology)青年会员和陕西省抗癌协会—转化医学青委会常委等,并于2021年组建“西安市国际科技合作基地”(细胞应激与疾病诊疗国际科技合作基地),开展技术转化工作,部分转化成果获得2022年陕西省科技工作者创新创业大赛二等奖。
合作学院团队负责人简介:
李昊博士长期致力于研究体重、体脂、血糖等代谢相关复杂表型和疾病的关键基因,和外在环境等调控因素及其相关机制,提出精准环境健康(Precision Environmental Health)的概念来概括研究饮食、营养、运动锻炼等一般外部环境因素对个体健康的影响。主要通过开发和利用系统遗传学分析方法来研究代谢相关表型和疾病的遗传和环境调控因素以及潜在机制,鉴定了数万个基因-表型关联,揭示了影响表型或疾病的关键基因,如Cpt1a影响禁食减肥效果,Rpl26调控体重和脂肪质量,Ces1c调控传统中药熊胆中最主要活性成分牛磺熊去氧胆酸TUDCA等。这些系统遗传学分析方法为相关表型或疾病的关键基因和潜在机制的发现提供重要手段和依据。迄今为止,申请人以第一作者发表在Cell Metabolism、Cell Systems、Genome Research、Trends in Genetics等高水平期刊发表学术论文。研究成果被同行亮点报道、正面评价和引用,总引用次数1400余次,H因子19。并利用所开发的系统遗传学方法和大数据建立了公开数据资源库网站www.systems-genetics.org,为领域内研究人员提供系统遗传学分析资源。相关研究获得欧洲分子生物学组织EMBO奖学金资助,累积主持或参与研究项目总经费超过400万欧元。申请人于2023年3月加入西安交通大学生命科学与技术学院,入选西安交通大学青年拔尖人才支持计划。
交叉团队方向简介:
生物信息学在生物医药等研究领域的引领作用日益凸显,随着大数据的发展,生物信息学研究将为精准医学发展和人类健康作出更多贡献。本团队以“生物信息学”为核心,以“精准医疗”为目的,充分融合生物大数据分析和医学技术,为我国重大疾病诊疗提供更多的技术支持,并加速相关成果的临床转化进程。现有团队在开发生物信息学和系统生物学算法等领域具有多年研究积累,并利用这些新算法和生物大数据对复杂表型和相关疾病的发生发展的潜在机制进行研究,探索可能的预防和治疗手段,相关成果在Cell Metabolism,Cell Systems等杂志发表。同时,针对肿瘤、神经系统疾病和肝脏疾病,团队已在“新型先导化合物研发”、“新型治疗模型建立”等方面取得了一系列突破,相关成果发表于Hepatology、PNAS等杂志。
招聘博士后拟进行的工作:
开发和利用生物信息学和系统生物学分析方法,分析挖掘临床医学大数据,鉴定代谢相关疾病发生发展的关键基因和潜在机制。寻求建立大数据分析预测模型,利用个体的遗传背景信息和分子水平数据,来预测营养或药物对特定个体的影响,为改善个体健康状态提供建议。另外通过依据鉴定出的关键基因或通路筛选营养物质或药物,寻求减少遗传和外界环境因素造成健康问题的潜在干预方法和手段,最终实现精准医疗的目的。
通过多重组学技术和临床研究模型,从临床角度解析肿瘤等临床重大疾病的关键发病机制,明确疾病发生和发展过程中的动态变化规律,并以此为基础开发新型治疗靶点,建立疾病的新型防治模型,进而促进疾病的精准医疗进程。